全蚀病
小麦全蚀病是一种根腐和茎腐性病害。小麦整个生育期均可感染。幼苗受侵，轻的症状不明显，重的显着矮化，叶色变浅，底部叶片发黄，分蘖减少，类似干旱缺肥状，拔出可见种子根和地下茎变成灰黑色。严重时，次生根变为黑色，植株枯死。
灌浆到成熟期这种症状尤为明显，在潮湿情况下，根茎变色部分形成基腐性的“黑脚”症状。后造成植株枯死，形成“白穗”。剥开有病部位基部叶鞘，可以看到全蚀病特有的“黑膏药”状物。土壤湿度大有利于病害的发展，晚秋或春季雨多年份发病重。碱性土让发病严重即PH高于7的发生严重。
防治方法：此病是一种土传病害，可在播种前用12%三唑醇可湿性粉剂按种子重量的0.02%-0.03%拌种。增施磷肥能减轻病害。
根腐病
在干旱半干旱地区，多引起茎基腐、根腐；多湿地区除以上症状外，还引起叶斑、茎枯、穗颈枯；小麦幼芽受害后变褐枯死，幼苗受害轻者芽鞘上产生条形或不规则形褐斑，重者幼苗变褐腐烂，称为苗腐。严重时，幼芽不能出土而枯死；在分蘖期，根茎部产生褐斑，叶鞘发生褐色腐烂，严重时也可引起幼苗死亡。轻病苗成株可抽穗，拔取病株可见茎节基部变褐，根毛表皮脱落。成株发病很易辨认不会于肥害混淆。冬前温度长时间在15-20℃时有利于发病。土壤粘重或地势低洼也会加重发病。
防治方法：①药剂拌种，用25%粉锈宁或50%福美双或50%扑海因可湿性粉剂拌种用量为种子重量的0.2%。②药剂防治，重病年及时喷药保护一次在小麦扬花期第二次在小麦乳熟初期药剂有25%三唑酮和50%福美双可湿性粉剂。