草缸的换水，是很重要的一个环节，会直接的影响到缸内生物的生存状况，和水草的长势。草缸一般每星期换水1/5——1/3比较合适，换水后可用各种方式除去自来水中的残留氯。（一般可采用事前或事后添加水质安定剂或除氯剂）。换水时可以进行一些水族箱清理工作、更换过滤绵、清洁玻璃、追加肥料、添加硝化细菌。
草缸换水的正确方法准备一条足够长的一般软水管，将一头扎上筛网，再取一个锁扣和一个较大的夹子。将夹子套在锁扣上，再将锁扣套在已扎上筛网的那头。（当然所选的锁扣要比水管稍小一点）。在换水的时候先将已扎上筛网的那头放入水中，再将夹子夹在玻璃边上以固定。然后把另一头套在水龙头上，打开水龙头见已有水流入水族箱，即可将套在水龙头的水管拔出。由于虹吸原理，水族箱中的水会被自然导流出来。到水族箱的水位到了所需要的高度，即可重新将水放入水族箱，直至到换水前的高度。整个换水过程不用10分种，轻松多啦！夏天应天气比较热水中的溶氧量低，水应多换一些，冬天可相应减少。根据经验夏天特别易滋生藻类，可能是高温促进水中生物加快新陈代谢，造成更多的养份释放到水中。所以更应多换些水。冬天换水时由于水温较底，应让水缓缓流入水族箱中，以使水温不至于相差太大。也可以分次数每次少量换水（因为不能象水族馆那样，将水温调整好后再加入水族箱）。
换水注意事项：水草缸除了在修剪时要注意之外，平时的换水同样也是非常重要的，尤其在换水时，需注意以下事项：1、最好在换水前，补充的新水事前做好水处理（气曝——消除水中氯气，水的消毒杀菌——消除藻类孢子、病源菌及细菌等）。2、注意换水时的水温控制，尤其在冬天时，换水速度要慢，换水量一次不宜过多。3、换水时如清洗过滤滤材时，要用缸中换下的水清洗，以免破坏滤材中的生态。4、换水时，建议将过滤器停止，使水流静止，再进行水缸中的清理工作，如括除藻类等（以免藻类随水流布满整缸）。5、更换新虑材不宜与换水工作同时进行，且应追加EM。6、换水时，添加新水的出水口，避免在红色水草等敏感性水草的上方，以免水质变化，导致水草停止生长。