主要矛盾和矛盾的主要方面在含义、外延、内涵、方法论方面都有所不同，例如主要矛盾是指在复杂事物的许多矛盾中，处于支配地位、对事物的发展起着决定作用的矛盾，而矛盾的主要方面则是指在每一种矛盾的矛盾双方中，处于支配地位并起着主导作用的一方。
二者外延的不同
主要矛盾是就复杂事物中所包含的“许多矛盾”相互比较而言的，而矛盾的主要方面则是就“同一矛盾”的矛盾双方相比较而言的。比较之后，发现主要矛盾一般只有一个，次要矛盾则可以有多个;而矛盾的主要方面是指每一矛盾中，矛盾的双方有主次之别，其地位和作用不平衡，主要和次要方面都只能有一个。
3、二者内涵不同
主次矛盾研究的是同一过程中同时存在的诸多矛盾之间的相互关系问题，主要讲的是这些矛盾的不平衡问题;矛盾的主次方面说的则是任何一个矛盾中两个方面之间的关系，是讲矛盾的两个方面之间的不平衡问题。
3、二者的方法论要求不同
主次矛盾关系的原理要求我们做工作要集中力量找出主要矛盾，从而找到解决复杂问题的关键。矛盾主次方面关系的原理要求我们在认识事物时，必须把握矛盾的主要方面，这样才能正确认识事物的主流和性质。